L’Ufficio Cooperazione missionaria tra le Chiese ha il compito di provvedere all’animazione missionaria della diocesi, alimentandone e promuovendone la missionarietà universale (missione ad gentes) e di essere lo strumento operativo per attuare le iniziative di cooperazione missionaria nella Chiesa di Genova.
L’Ufficio realizza l’animazione missionaria della diocesi anche avvalendosi di tutte le forze missionarie, sia quelle che operano nelle parrocchie e nei vicariati (delegati o incaricati missionari), sia gli istituti, le associazioni e i movimenti missionari attivi in diocesi, il cui carisma è riconosciuto dal Vescovo diocesano. Tale coordinamento avviene tramite il Centro Missionario Diocesano.
All’Ufficio è affidata anche la direzione diocesana delle Pontificie Opere Missionarie ed il compito di promuoverne tutto l’articolato servizio.